269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1517 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  100 
 
 		 84 aa  165  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  44 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  41.56 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  44.29 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  44.3 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  43.66 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  43.66 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  45.07 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  45.83 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  45.83 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  41.43 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  44 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  43.66 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  43.66 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  40.79 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  38.89 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  38.96 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  35 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  43.48 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  44 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  44 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  38.96 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  42.25 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  39.47 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  42.25 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  41.33 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  41.1 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  38.57 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2904  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  37.5 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  48.33 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  42.42 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  47.37 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  43.66 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  36.84 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  41.33 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  40.26 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  40.26 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  42.42 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  42.42 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  42.42 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  42.42 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  42.42 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  42.42 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  42.42 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  42.42 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  42.42 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  40.85 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  38.57 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  47.95 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  40.85 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  40.85 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  40.85 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  32.93 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>