More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1285 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  100 
 
 
410 aa  820    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  42.05 
 
 
450 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4164  putative monoxygenase  44.04 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0321225  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  41.77 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  41.96 
 
 
401 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  39.13 
 
 
455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  36.7 
 
 
424 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4190  FAD-binding domain protein  35.09 
 
 
452 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3295  monooxygenase FAD-binding protein  35.13 
 
 
379 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5650  monooxygenase FAD-binding  34.13 
 
 
416 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  0.804587 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07897  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00660)  32.17 
 
 
393 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.467263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2587  putative monoxygenase  36.31 
 
 
409 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  29.53 
 
 
393 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  30.21 
 
 
413 aa  99.8  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  31.45 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  27.56 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  27.18 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01311  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  29.04 
 
 
392 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  32.6 
 
 
378 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  31.11 
 
 
376 aa  90.1  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  29.69 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  26.17 
 
 
382 aa  89.7  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  26.55 
 
 
384 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  29.3 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  25.69 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.33 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  28.79 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  28.19 
 
 
382 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  29.97 
 
 
378 aa  86.7  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  34.33 
 
 
509 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2626  monooxygenase FAD-binding  31.15 
 
 
519 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  21.67 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  28.91 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  28.02 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  25.98 
 
 
388 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08588  conserved hypothetical protein  28.12 
 
 
541 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.53 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  27.6 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  25.75 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  34.66 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.55 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  29.08 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.33 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  28.67 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  29.34 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  25.06 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.3 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.74 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.58 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  27.6 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  25.94 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  25.75 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  28.76 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  26.34 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  23.8 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06750  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.123632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  24.94 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  27.59 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  25.79 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  28.72 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.11 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.39 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  25.28 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  24.14 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43564  Aromatic-ring hydroxylase  25.25 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.193664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  27.7 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4263  monooxygenase FAD-binding  31.8 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000952252  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.45 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  27.49 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  34.86 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  25.96 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  27.85 
 
 
557 aa  69.7  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  27.63 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  25.63 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  27.15 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  25.21 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  34.59 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  27.86 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  26.94 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  34.59 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3699  monooxygenase FAD-binding  32.65 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  28.03 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  27.37 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  29.37 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  34.29 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  34.29 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  37.21 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03227  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 
504 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  21.88 
 
 
377 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  25.32 
 
 
391 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  23.61 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  24.9 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  34.46 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.11 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  26.04 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2826  monooxygenase, FAD-binding  25.63 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00129396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  28.52 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>