87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3190 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3190  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.840017 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3929  ferredoxin  92.63 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3190  2Fe-2S ferredoxin  92.63 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0760  ferredoxin, 2Fe-2S  63.83 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  57.89 
 
 		 94 aa  120  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1450  ferredoxin  57.45 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  41.46 
 
 		 561 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1001  hypothetical protein  35.71 
 
 		 308 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000133962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4453  hypothetical protein  35.71 
 
 		 306 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883054 
 
 
-
 
NC_002620  TC0329  ferredoxin  37.18 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.378645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0938  hypothetical protein  35.71 
 
 		 306 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0899  hypothetical protein  35.71 
 
 		 306 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  34.57 
 
 		 670 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  32.97 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  37.14 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  31.03 
 
 		 597 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4450  hypothetical protein  30.99 
 
 		 311 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.4 
 
 		 669 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  34.62 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.71 
 
 		 688 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  34.21 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  32.93 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.12 
 
 		 702 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3470  ferredoxin  31.58 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  32 
 
 		 347 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.07 
 
 		 337 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4338  oxidoreductase, iron-sulfur-binding protein  30.99 
 
 		 312 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  43.9 
 
 		 774 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  35.21 
 
 		 319 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  46.67 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  38.03 
 
 		 571 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4030  hypothetical protein  31.25 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40 
 
 		 676 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  34.25 
 
 		 344 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  35.79 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  41.3 
 
 		 319 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40 
 
 		 700 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56260  hypothetical protein  37.18 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  30.88 
 
 		 226 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  45.45 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  37.74 
 
 		 691 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30 
 
 		 358 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  39.76 
 
 		 592 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  30.26 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  45.45 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1528  ferredoxin  31.51 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.87 
 
 		 686 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 		 574 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  30.38 
 
 		 351 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  45.24 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  33.33 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  36.96 
 
 		 678 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  46.15 
 
 		 331 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.63 
 
 		 677 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  31.48 
 
 		 88 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  27.85 
 
 		 352 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 575 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  37.78 
 
 		 676 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.96 
 
 		 678 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.49 
 
 		 315 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  36.07 
 
 		 366 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 		 572 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  34.55 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  37.84 
 
 		 366 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.13 
 
 		 687 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  26.97 
 
 		 625 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  38.78 
 
 		 321 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  41.51 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  33.33 
 
 		 322 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  31.48 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  29.31 
 
 		 356 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  31.43 
 
 		 321 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  33.33 
 
 		 361 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  32.98 
 
 		 612 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.99 
 
 		 467 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 		 346 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0651  ferredoxin  29.11 
 
 		 353 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.14 
 
 		 331 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  32.91 
 
 		 222 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  36.59 
 
 		 553 aa  40  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.5 
 
 		 349 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.62 
 
 		 112 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 		 90 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  34.62 
 
 		 101 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.78 
 
 		 368 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.5 
 
 		 349 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>