More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3167 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5232  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  70.3 
 
 
498 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88595  normal  0.882474 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3167  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  980    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662666  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3703  aldehyde dehydrogenase  71.31 
 
 
498 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5500  Aldehyde Dehydrogenase  70.91 
 
 
498 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2417  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.39 
 
 
525 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.02914  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3471  aldehyde dehydrogenase  66.6 
 
 
498 aa  630  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.793386  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0289  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  61.54 
 
 
483 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2692  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.88 
 
 
491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.41255  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  51.57 
 
 
482 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
482 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.23 
 
 
482 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.02 
 
 
482 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.64 
 
 
483 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
485 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.23 
 
 
482 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.81 
 
 
483 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.02 
 
 
483 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.23 
 
 
480 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  53.03 
 
 
491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.02 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.02 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.02 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  47.6 
 
 
482 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.6 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.02 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.02 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.17 
 
 
486 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.6 
 
 
482 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  47.6 
 
 
482 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.02 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.6 
 
 
482 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.02 
 
 
482 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.02 
 
 
482 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
486 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.27 
 
 
483 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.39 
 
 
489 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  49.59 
 
 
489 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
489 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
489 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.18 
 
 
480 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.97 
 
 
503 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
489 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.2 
 
 
490 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
482 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
489 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
479 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.76 
 
 
503 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.49 
 
 
496 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
486 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
493 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
492 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2886  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.01 
 
 
486 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.74 
 
 
479 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.98 
 
 
489 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.74 
 
 
479 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4212  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.77 
 
 
489 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.18 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4422  succinate-semialdehyde dehydrogenase, putative  50.21 
 
 
490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.86 
 
 
486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
499 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
482 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
489 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.64 
 
 
500 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
489 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
492 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
483 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
499 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
489 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
493 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
489 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
482 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.4 
 
 
490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.91 
 
 
489 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.72 
 
 
482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.1 
 
 
493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.72 
 
 
482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.3 
 
 
488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.41 
 
 
485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.99 
 
 
486 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2286  aldehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595022  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.85 
 
 
483 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.79 
 
 
484 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
492 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 
484 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  48.96 
 
 
480 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.44 
 
 
492 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.04 
 
 
490 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.02 
 
 
488 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.86 
 
 
492 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
484 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
484 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.43 
 
 
484 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0134  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
495 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 
483 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>