279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0752 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  100 
 
 		 319 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  64.29 
 
 		 309 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  66.44 
 
 		 309 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  62.17 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  57.89 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  57.77 
 
 		 301 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  56.25 
 
 		 300 aa  346  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  57.1 
 
 		 301 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  56.19 
 
 		 318 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  57.49 
 
 		 317 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  57.49 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  56.7 
 
 		 316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  57.14 
 
 		 317 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  56.45 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  56.45 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  56.45 
 
 		 317 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  54.73 
 
 		 306 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  54.34 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  53.72 
 
 		 305 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  54.3 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  52.74 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  50.16 
 
 		 316 aa  302  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  51.68 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  49.83 
 
 		 333 aa  285  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  47.77 
 
 		 381 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  48.98 
 
 		 301 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  50.68 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  51.37 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  45.28 
 
 		 305 aa  268  8e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  47.47 
 
 		 308 aa  265  8.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  47.06 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  46.44 
 
 		 305 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  46.44 
 
 		 305 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  46.44 
 
 		 305 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  46.94 
 
 		 309 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  43.1 
 
 		 318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  43.49 
 
 		 316 aa  242  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  42.47 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  43.34 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  41.22 
 
 		 307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  41.16 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  44.6 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  40.27 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  38.59 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  37.81 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  37.81 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  37.81 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.38 
 
 		 321 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  37.05 
 
 		 315 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  39.4 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  36.63 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  35.11 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  39.59 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  35.11 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  35.11 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  35.11 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  35.11 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  35.11 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  35.34 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  35.11 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  35.11 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  36.36 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  38.16 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  36.17 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  36.88 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  37.81 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  33.33 
 
 		 283 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  35.81 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  34.75 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  37.86 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  35.34 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  35.47 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  35.34 
 
 		 277 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  35.47 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  34.92 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  36.39 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  35.47 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  34.72 
 
 		 280 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  38.11 
 
 		 277 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  34.63 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  34.98 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  35.37 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  35.15 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  35.15 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  36.21 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  35.36 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  36.75 
 
 		 277 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  36.21 
 
 		 282 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  33.65 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  34.24 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  35.27 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  35.86 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  34.12 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  36.4 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  33.92 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  34.83 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  35.84 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  33.8 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  33.45 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.81 
 
 		 282 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>