82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3698 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.18 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.39 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.34 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.43 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.36 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.15 
 
 		 339 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.82 
 
 		 315 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.52 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.82 
 
 		 315 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.28 
 
 		 302 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.78 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 312 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.73 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  34.73 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  30.94 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.73 
 
 		 313 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.14 
 
 		 332 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.6 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.77 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.98 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.4 
 
 		 268 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.06 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.2 
 
 		 315 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  31.95 
 
 		 203 aa  89  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.53 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.36 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.94 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  30.57 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.34 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.75 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.94 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.42 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.32 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  26.97 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.75 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  25.47 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  29.03 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  24.84 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.4 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.51 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.81 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.48 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  25.58 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  30.56 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.08 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  23.03 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.28 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.11 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.67 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.25 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  30.99 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  30.25 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0706  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.08 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1842  outer-membrane lipoprotein carrier protein  36.36 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0106  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.35 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0095  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.35 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0795  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.89 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.32 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0088  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.2 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700906  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  30.99 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1121  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.79 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310503  normal  0.176319 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.82 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  33.82 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.53 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3440  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.17 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.16 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.72 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2599  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.88 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.29 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2459  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.99 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00395649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.89 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0686  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.96 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.7 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.42 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2758  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.21 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0626  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.56 
 
 		 198 aa  41.6  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0165352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>