201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3148 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3148  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1043    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.358064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0464  protein of unknown function DUF323  35.43 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2146  hypothetical protein  36.53 
 
 		 520 aa  293  6e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4233  hypothetical protein  34.94 
 
 		 511 aa  292  9e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52010  hypothetical protein  36.95 
 
 		 508 aa  270  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2626  hypothetical protein  36.93 
 
 		 515 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00927742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2877  hypothetical protein  36.07 
 
 		 502 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.112467  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3870  hypothetical protein  39.75 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0563781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3133  hypothetical protein  39.49 
 
 		 538 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280232  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3420  hypothetical protein  38.73 
 
 		 538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4058  hypothetical protein  34.66 
 
 		 545 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00410401  normal  0.150946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3222  protein of unknown function DUF323  37.57 
 
 		 512 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33154  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0903  hypothetical protein  39.62 
 
 		 537 aa  199  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0493505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0142  hypothetical protein  32.96 
 
 		 570 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00830  hypothetical protein  32.74 
 
 		 570 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.313618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2310  hypothetical protein  32.22 
 
 		 601 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0333269  hitchhiker  0.0000166266 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1319  protein of unknown function DUF323  32.66 
 
 		 569 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1667  hypothetical protein  35.1 
 
 		 569 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  30.17 
 
 		 282 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  28.79 
 
 		 323 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  34.42 
 
 		 224 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  31.12 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  32.24 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  33.74 
 
 		 289 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  31.16 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  26.75 
 
 		 802 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  33.54 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  31.78 
 
 		 535 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  31.87 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  33.12 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  32.64 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  34.67 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  31.79 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  35.15 
 
 		 892 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  33.55 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1196 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  32.7 
 
 		 768 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  27.78 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4493  hypothetical protein  33.82 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  30.37 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  28.57 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  36.8 
 
 		 336 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  30.21 
 
 		 263 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  38.33 
 
 		 237 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  30.62 
 
 		 654 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  28.66 
 
 		 225 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  29.76 
 
 		 522 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  30.99 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  28.96 
 
 		 276 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 715 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  31.61 
 
 		 293 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  31.41 
 
 		 226 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  27.14 
 
 		 922 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  32.8 
 
 		 616 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2148  hypothetical protein  38.66 
 
 		 325 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0453912  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  36.23 
 
 		 370 aa  54.3  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  31.08 
 
 		 262 aa  54.3  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  42.31 
 
 		 327 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  37.74 
 
 		 359 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  29.49 
 
 		 334 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1911 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 		 882 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  28.65 
 
 		 277 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  34.29 
 
 		 341 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  29.03 
 
 		 267 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  31.93 
 
 		 338 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  26.84 
 
 		 623 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  26.94 
 
 		 603 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  31.61 
 
 		 657 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  29.45 
 
 		 862 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  33.6 
 
 		 321 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  30.13 
 
 		 375 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.65 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.65 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  37.78 
 
 		 351 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 		 617 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.11 
 
 		 308 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  35.79 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 		 621 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.14 
 
 		 820 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  35.83 
 
 		 668 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  25.47 
 
 		 267 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  38.37 
 
 		 230 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  34.53 
 
 		 356 aa  50.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  28.83 
 
 		 288 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  31.79 
 
 		 952 aa  50.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 		 593 aa  50.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  28.57 
 
 		 225 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  28.82 
 
 		 358 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  35.79 
 
 		 408 aa  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  26.16 
 
 		 654 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  31.47 
 
 		 497 aa  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  30.66 
 
 		 292 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  30.66 
 
 		 292 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 		 298 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  33.56 
 
 		 330 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 637 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  27.53 
 
 		 636 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  31.72 
 
 		 312 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>