47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3124 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 280 aa  555  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.21 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.86 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.36 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.21 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.43 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.54 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  37.72 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1934  alpha/beta hydrolase fold  42.69 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2342  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.76 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0305  hypothetical protein  40.68 
 
 		 131 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  25 
 
 		 585 aa  72  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  27.78 
 
 		 636 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  31.75 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  34.19 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  38.32 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  29.1 
 
 		 592 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  30.85 
 
 		 631 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  22.63 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  37.69 
 
 		 618 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  27.1 
 
 		 638 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  26.48 
 
 		 638 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  30.73 
 
 		 615 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.76 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  30.4 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  35.11 
 
 		 618 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.78 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13091  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  24.65 
 
 		 355 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  28.77 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  30.86 
 
 		 595 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  26.41 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  36.26 
 
 		 634 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  33.08 
 
 		 618 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  22.94 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  24.03 
 
 		 405 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0478  hypothetical protein  29.79 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.218864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  30.77 
 
 		 592 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  27.03 
 
 		 597 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  29.7 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  25.99 
 
 		 605 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  37.08 
 
 		 658 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  30.54 
 
 		 462 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  37.08 
 
 		 658 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  37.08 
 
 		 636 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  37.08 
 
 		 658 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  30.54 
 
 		 293 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>