54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2732 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1008    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  62.4 
 
 		 516 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  60.92 
 
 		 513 aa  581  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  61.11 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  64.29 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  61.88 
 
 		 506 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  64.34 
 
 		 498 aa  578  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  61.51 
 
 		 504 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  62.5 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  61.48 
 
 		 507 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  62.77 
 
 		 500 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  60.97 
 
 		 503 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  60 
 
 		 502 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  59.44 
 
 		 526 aa  551  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  60.56 
 
 		 504 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  60.59 
 
 		 504 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  59.88 
 
 		 500 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  62.53 
 
 		 520 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  59.68 
 
 		 499 aa  528  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  59.68 
 
 		 499 aa  528  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  59.65 
 
 		 498 aa  527  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  58.85 
 
 		 490 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  59.24 
 
 		 498 aa  524  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  55.22 
 
 		 492 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  54.08 
 
 		 504 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  25.6 
 
 		 537 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.82 
 
 		 744 aa  62  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  24.02 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  25.41 
 
 		 595 aa  57  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  24.05 
 
 		 655 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  33.52 
 
 		 608 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  33.52 
 
 		 608 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  24.07 
 
 		 659 aa  50.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  24.32 
 
 		 580 aa  50.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  30.83 
 
 		 574 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  27.11 
 
 		 524 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  27.11 
 
 		 560 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  29.78 
 
 		 1076 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  24.22 
 
 		 628 aa  47  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  26.79 
 
 		 664 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  24.24 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  30.36 
 
 		 582 aa  46.2  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  35.2 
 
 		 572 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  30.56 
 
 		 577 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  27.63 
 
 		 674 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  29.6 
 
 		 554 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  34.72 
 
 		 579 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  29.6 
 
 		 554 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  27.48 
 
 		 603 aa  44.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  26.42 
 
 		 567 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  33.8 
 
 		 570 aa  43.9  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  30.69 
 
 		 645 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  26.54 
 
 		 611 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2018  FtsK/SpoIIIE family protein  25.73 
 
 		 553 aa  43.5  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>