50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2137 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 176 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  37.77 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  36.7 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  32.45 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  34.04 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  31.47 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  32.45 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  36.7 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  36.17 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  38.3 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  34.86 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  34.5 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  34.5 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  34.57 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  37.23 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  35.64 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  31.38 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  34.22 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  35.64 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  31.32 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  38.17 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  32.65 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  32.73 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  34.51 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  35.64 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  31.25 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  31.25 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  37.1 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  31.25 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  29.41 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  31.94 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  28.88 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  28.88 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  28.88 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  33.92 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  30.64 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  32.63 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  30.64 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  31.84 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  26.74 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  29.34 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  27.17 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  31.34 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  32.77 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  28.26 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  27.68 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  31.5 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4946  hypothetical protein  26.26 
 
 		 225 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  30.53 
 
 		 575 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>