More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2060 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  40.58 
 
 		 1018 aa  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  40.68 
 
 		 1018 aa  697    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1747  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.34 
 
 		 1018 aa  696    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1496  FAD linked oxidase  40.64 
 
 		 1018 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237885  hitchhiker  0.00132557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4493  FAD linked oxidase domain protein  41.08 
 
 		 1006 aa  685    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  40.58 
 
 		 1018 aa  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1739  oxidase, FAD binding  39.4 
 
 		 1018 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6630  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.41 
 
 		 1018 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2998  FAD binding protein  36.28 
 
 		 1069 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.786672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2596  hypothetical protein  39.5 
 
 		 1018 aa  684    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2453  FAD linked oxidase domain protein  39.84 
 
 		 1017 aa  687    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  39.2 
 
 		 1013 aa  676    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2805  oxidoreductase, FAD-binding, putative  39.34 
 
 		 1015 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5809  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.38 
 
 		 1017 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.12 
 
 		 1015 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  39.64 
 
 		 1021 aa  675    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.48 
 
 		 1018 aa  692    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2176  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.74 
 
 		 1018 aa  688    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0114816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  35.55 
 
 		 1006 aa  643    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8323  FAD linked oxidase domain protein  40.85 
 
 		 1022 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  40.58 
 
 		 1018 aa  692    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  40.4 
 
 		 1009 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7704  FAD linked oxidase  41.32 
 
 		 1017 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  40.78 
 
 		 1018 aa  697    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1419  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.78 
 
 		 1006 aa  681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  40.48 
 
 		 1018 aa  692    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  100 
 
 		 978 aa  1948    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02063  hypothetical protein  39.84 
 
 		 1011 aa  711    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1691  FAD linked oxidase domain protein  39.82 
 
 		 1019 aa  675    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4607  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.02 
 
 		 1017 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173184  normal  0.281232 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.96 
 
 		 1023 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  38.99 
 
 		 1013 aa  677    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1807  FAD linked oxidase  40.62 
 
 		 1018 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  40.68 
 
 		 1018 aa  695    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.34 
 
 		 1024 aa  667    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  40.36 
 
 		 1010 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  38.43 
 
 		 1016 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  40.58 
 
 		 1018 aa  692    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.28 
 
 		 1005 aa  690    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001538  Fe-S oxidoreductase  38.47 
 
 		 1015 aa  696    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  41.21 
 
 		 1018 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.99 
 
 		 1013 aa  683    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  39.66 
 
 		 1013 aa  699    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1872  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.8 
 
 		 1019 aa  677    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000561674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1477  FAD linked oxidase domain protein  40.54 
 
 		 1018 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  35.77 
 
 		 1031 aa  659    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.56 
 
 		 1013 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2548  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.04 
 
 		 1016 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.8 
 
 		 1013 aa  683    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3999  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.08 
 
 		 1006 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.58 
 
 		 1023 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1845  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.4 
 
 		 1018 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2755  FAD linked oxidase domain protein  39.58 
 
 		 1017 aa  681    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.190253  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.38 
 
 		 1017 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  41.8 
 
 		 1012 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.21 
 
 		 1018 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.26 
 
 		 1013 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.59 
 
 		 1027 aa  701    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1737  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.76 
 
 		 1013 aa  684    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.187765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2714  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.18 
 
 		 1023 aa  671    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488036  normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4140  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.81 
 
 		 1017 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1461  FAD linked oxidase domain protein  40.54 
 
 		 1018 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.236754 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2062  FAD linked oxidase  39.52 
 
 		 1010 aa  696    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2071  oxidoreductase, FAD-binding, putative  39.74 
 
 		 1007 aa  663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.999206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003726  Fe-S oxidoreductase  40.12 
 
 		 1011 aa  704    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000740961  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  35.75 
 
 		 1002 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1450  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.52 
 
 		 1014 aa  671    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1978  FAD linked oxidase  40.64 
 
 		 1018 aa  698    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000994047 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0818  hypothetical protein  40.78 
 
 		 1021 aa  708    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.13 
 
 		 1024 aa  702    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.1 
 
 		 1013 aa  679    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.19 
 
 		 1026 aa  660    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2480  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.86 
 
 		 1013 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5622  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.99 
 
 		 1020 aa  627  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8623  FAD linked oxidase domain protein  39.92 
 
 		 1067 aa  625  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1604  hypothetical protein  35.82 
 
 		 966 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2316  FAD linked oxidase-like protein  45.89 
 
 		 1091 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0331253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.5 
 
 		 978 aa  432  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.1 
 
 		 976 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.3 
 
 		 995 aa  412  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.09 
 
 		 983 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  33.98 
 
 		 974 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.13 
 
 		 990 aa  392  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  32.21 
 
 		 1013 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.85 
 
 		 990 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.91 
 
 		 990 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.61 
 
 		 991 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.54 
 
 		 1005 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 		 1014 aa  379  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  29.65 
 
 		 967 aa  376  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  28.99 
 
 		 975 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.37 
 
 		 999 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.94 
 
 		 962 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.96 
 
 		 1007 aa  370  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.41 
 
 		 971 aa  366  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.73 
 
 		 989 aa  365  2e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  31.28 
 
 		 1024 aa  365  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.72 
 
 		 977 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  30.7 
 
 		 973 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.72 
 
 		 1046 aa  361  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>