204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2030 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  66.98 
 
 		 218 aa  307  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  65.09 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  63.68 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  63.76 
 
 		 224 aa  298  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  63.76 
 
 		 224 aa  298  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  62.04 
 
 		 225 aa  295  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  65.4 
 
 		 223 aa  295  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  63.68 
 
 		 215 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  62.84 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  61.99 
 
 		 225 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  61.61 
 
 		 225 aa  291  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  61.61 
 
 		 225 aa  291  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  63.98 
 
 		 230 aa  291  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  63.03 
 
 		 229 aa  289  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  62.26 
 
 		 215 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  60.09 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  62.26 
 
 		 215 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  60.09 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  61.79 
 
 		 215 aa  289  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  62.56 
 
 		 224 aa  289  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  61.79 
 
 		 215 aa  287  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  59.63 
 
 		 218 aa  286  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  59.45 
 
 		 221 aa  287  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  61.32 
 
 		 215 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  59.45 
 
 		 221 aa  286  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  59.63 
 
 		 218 aa  285  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  61.57 
 
 		 217 aa  285  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  61.47 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  58.26 
 
 		 219 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  60.56 
 
 		 218 aa  281  6.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  58.26 
 
 		 219 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  61.86 
 
 		 218 aa  278  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  59.72 
 
 		 217 aa  278  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  60.38 
 
 		 235 aa  278  5e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  59.72 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  59.53 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  64.1 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  64.1 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  58.8 
 
 		 217 aa  271  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  56.02 
 
 		 241 aa  260  8.999999999999999e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  55.56 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2585  hypothetical protein  56.13 
 
 		 217 aa  258  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133962  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_002978  WD0706  hypothetical protein  44.04 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0892  hypothetical protein  43.32 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  44 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  44 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  38.65 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  38.65 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  32.39 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  33.5 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  34.67 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  35.53 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  33.5 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  35 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  35.03 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  33.64 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  35.37 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  35.82 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.98 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  35.32 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  33.03 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  33.84 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  33.84 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  37.89 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.18 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  35.38 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  34.98 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  34.2 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  33.86 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.68 
 
 		 237 aa  101  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  34.95 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  35.92 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  32.71 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  32.54 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  32.43 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  32.52 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  35.57 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  34.93 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  36.14 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  35.15 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.08 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.08 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.08 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  37.08 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.08 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  33.01 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  31.4 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.08 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.96 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  31.56 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  35.39 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  35.96 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  35.96 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  35.96 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  35.96 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.39 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  33.97 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  34.02 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>