220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1366 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  40.07 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  38.71 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  37.54 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  35.18 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 330 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  35.64 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  36.22 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  34.95 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3585  hypothetical protein  32.89 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0184789  normal  0.871841 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  32.27 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  32.9 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  31.48 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  33.33 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  31.21 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  33.33 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  33.33 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  31.79 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  31.79 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  29.71 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  33.33 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  33.01 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  30.19 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0914  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  28.62 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  29.62 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  29.62 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  29.62 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  29.62 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  29.62 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  29.62 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  29.3 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5918  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  31.29 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  31.29 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  31.29 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  31.29 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1720  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 331 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.925466  normal  0.0186791 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 363 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  31.29 
 
 		 319 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  31.63 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  28.62 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1977  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  27.21 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  26.89 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  26.89 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  26.56 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  32.46 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  26.23 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  28.21 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  30.06 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.88 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  27.88 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.88 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.88 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.88 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  31.44 
 
 		 694 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.56 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 315 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  28.44 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  28.44 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  28.44 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  28.44 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  28.44 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  28.44 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.56 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>