More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0797 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  780    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  52.12 
 
 		 390 aa  346  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 		 408 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 398 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  31.4 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2491  major facilitator superfamily MFS_1  46.9 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259249  normal  0.0455344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8422  MFS transporter  38.9 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  32.87 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 388 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  34.55 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 408 aa  160  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 391 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 416 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  34 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  32.56 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  32.56 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  32.56 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  32.56 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  32.97 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  32.56 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  32.28 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 390 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  31.12 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  28.32 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 431 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 391 aa  153  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 394 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 391 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  34.44 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 401 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 401 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 401 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 392 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  28.04 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  28.31 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  32.63 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  32.63 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4809  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 418 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 390 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 405 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 409 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.79 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 408 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 382 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  32.63 
 
 		 389 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 401 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0416  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 388 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1854  transporter, major facilitator family  32.02 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000789042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  33.04 
 
 		 393 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>