269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0279 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 		 375 aa  756    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  56.71 
 
 		 393 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  57.95 
 
 		 404 aa  428  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  57.56 
 
 		 383 aa  428  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  57.67 
 
 		 398 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  57.53 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  57.81 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  59.18 
 
 		 390 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.24 
 
 		 388 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  57.42 
 
 		 374 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  58.52 
 
 		 383 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  58.24 
 
 		 370 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  56.99 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  56.67 
 
 		 387 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  62.03 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.67 
 
 		 382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57.51 
 
 		 380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.5 
 
 		 349 aa  391  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  61.61 
 
 		 344 aa  391  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  55.65 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  54.03 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  65.44 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  54.69 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  55.43 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  58.46 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  55.56 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  57.1 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  56.64 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  59.28 
 
 		 349 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.6 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  57.18 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  55.62 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  55.79 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  55.33 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  56.08 
 
 		 347 aa  364  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  61.68 
 
 		 325 aa  361  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  56.57 
 
 		 350 aa  355  5e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  47.65 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.44 
 
 		 355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  46.11 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  46.53 
 
 		 363 aa  292  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  45.19 
 
 		 385 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  46.29 
 
 		 438 aa  288  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  46.22 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  46.51 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  43.93 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  45.71 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  45.14 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  43.87 
 
 		 354 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  43.59 
 
 		 354 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  43.28 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.59 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  44.31 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  45.19 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  40.68 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.26 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  42.6 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  41.6 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  42.27 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  45.11 
 
 		 372 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  41.98 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  45 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  40.33 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  40.33 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  40.33 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  40.33 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  40.33 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  40.33 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  40.33 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  44.54 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.88 
 
 		 348 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  42.98 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  42.49 
 
 		 379 aa  269  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  42.9 
 
 		 370 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  40.82 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  40.33 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.26 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  40.33 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  40.76 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  41.64 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  42.94 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.15 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  41.18 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  42.17 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.94 
 
 		 357 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  45.72 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.12 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.82 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.59 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.59 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.59 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  40.91 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.89 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.91 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.59 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0567  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.2 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000095746 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.59 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  38.61 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  42.05 
 
 		 385 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>