287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3404 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2876  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  58.55 
 
 		 1155 aa  1318    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.66593 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3847  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  75.08 
 
 		 1193 aa  1786    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0083  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.85 
 
 		 1187 aa  1086    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3608  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.5 
 
 		 1161 aa  1161    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1174  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  49.62 
 
 		 1157 aa  1005    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0417  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  48.9 
 
 		 1195 aa  1063    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.114181 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5688  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.5 
 
 		 1182 aa  1119    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0608745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0820  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.83 
 
 		 1143 aa  1051    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0378  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50.13 
 
 		 1191 aa  1038    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179398  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  93.09 
 
 		 1187 aa  2230    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2079  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.35 
 
 		 1157 aa  1123    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3155  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase family protein  57.16 
 
 		 1160 aa  1291    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  75 
 
 		 1193 aa  1783    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3021  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  56.92 
 
 		 1160 aa  1296    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0267  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  59.63 
 
 		 1150 aa  1357    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0896  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.1 
 
 		 1128 aa  1016    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0193529 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3887  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  61.96 
 
 		 1206 aa  1482    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.398161  normal  0.512264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2777  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.54 
 
 		 1186 aa  919    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.917164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6218  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.71 
 
 		 1176 aa  1013    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6355  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  58.74 
 
 		 1214 aa  1380    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3233  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  80.95 
 
 		 1197 aa  2000    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5301  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  58.06 
 
 		 1186 aa  1370    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5840  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  76.28 
 
 		 1186 aa  1832    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4222  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40.47 
 
 		 1168 aa  789    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28845  normal  0.848789 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3404  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 		 1186 aa  2439    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3801  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  56.18 
 
 		 1192 aa  1310    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737264  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0246  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  74.83 
 
 		 1196 aa  1787    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1745  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.28 
 
 		 1165 aa  1157    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.255396 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0018  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  75.08 
 
 		 1193 aa  1785    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0563  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  49.75 
 
 		 1191 aa  1036    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.453364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2948  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.8 
 
 		 1128 aa  1013    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2438  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51 
 
 		 1139 aa  1013    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4008  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.67 
 
 		 1206 aa  1476    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7701 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0299  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  74.62 
 
 		 1196 aa  1805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3418  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  74.54 
 
 		 1196 aa  1805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6292  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50.39 
 
 		 1190 aa  1031    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3502  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.97 
 
 		 1186 aa  1532    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3673  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  74.96 
 
 		 1199 aa  1844    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000976123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1554  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.87 
 
 		 1155 aa  1050    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4433  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40.49 
 
 		 1148 aa  778    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3525  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  75.08 
 
 		 1193 aa  1786    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.651962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6838  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  38.69 
 
 		 1239 aa  707    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1972  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  75.08 
 
 		 1193 aa  1786    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2324  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  54.99 
 
 		 1161 aa  1160    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600214  normal  0.14397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2185  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  54.95 
 
 		 1168 aa  1237    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5013  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.05 
 
 		 1163 aa  1181    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353185 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0001  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  75.08 
 
 		 1193 aa  1786    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572311  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  74.14 
 
 		 1200 aa  1826    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1663  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.8 
 
 		 1170 aa  843    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0328  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50.17 
 
 		 1191 aa  1045    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3108  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  73.83 
 
 		 1193 aa  1793    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1835  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.89 
 
 		 1179 aa  838    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0221  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  75.46 
 
 		 1196 aa  1828    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.530099  hitchhiker  0.000000183549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1594  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.97 
 
 		 1128 aa  1016    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0266252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2349  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.27 
 
 		 1161 aa  1177    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1031  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40.3 
 
 		 1149 aa  729    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0621498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3786  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  74.92 
 
 		 1193 aa  1781    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0095  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  55.11 
 
 		 1228 aa  1257    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.602888  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2176  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.38 
 
 		 1132 aa  992    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0667179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  59.65 
 
 		 1218 aa  1432    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5543  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  73.66 
 
 		 1195 aa  1753    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00134881  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2022  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.66 
 
 		 1144 aa  931    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3387  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  53.38 
 
 		 1163 aa  1188    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4647  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.3 
 
 		 1187 aa  1495    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0357  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50.21 
 
 		 1190 aa  1042    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0285  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  74.4 
 
 		 1199 aa  1833    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4290  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  49.07 
 
 		 1195 aa  1056    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0361  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  71.48 
 
 		 1199 aa  1739    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0614  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  71.36 
 
 		 1192 aa  1709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23102  normal  0.0754144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4090  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  61.79 
 
 		 1204 aa  1450    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2962  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  49.92 
 
 		 1190 aa  1033    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1784  Pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase  40.65 
 
 		 1194 aa  778    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0840  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.45 
 
 		 1193 aa  1488    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3116  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.92 
 
 		 1161 aa  1177    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0262432  normal  0.624015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1036  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  60.98 
 
 		 1198 aa  1387    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2851  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50.39 
 
 		 1190 aa  1041    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2178  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.74 
 
 		 1164 aa  1176    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3396  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  81.54 
 
 		 1197 aa  2009    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3680  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.68 
 
 		 1139 aa  974    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1120  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.3 
 
 		 1139 aa  1033    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.429591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2326  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50.39 
 
 		 1190 aa  1035    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2787  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  74.62 
 
 		 1196 aa  1805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3095  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  43.95 
 
 		 1180 aa  918    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2811  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  53.39 
 
 		 1157 aa  1136    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0398  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  49.75 
 
 		 1191 aa  1036    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0390  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  54.62 
 
 		 1159 aa  1177    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0238  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  74.75 
 
 		 1196 aa  1809    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2988  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50.21 
 
 		 1190 aa  1037    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6233  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  51.71 
 
 		 1167 aa  1113    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6435  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.24 
 
 		 1168 aa  1078    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.681075  normal  0.154536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0319  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  74.62 
 
 		 1196 aa  1805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2940  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50.39 
 
 		 1190 aa  1035    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1834  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  51.64 
 
 		 1171 aa  1137    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3030  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.45 
 
 		 1169 aa  1031    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  54.38 
 
 		 1235 aa  1233    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  75.08 
 
 		 1193 aa  1786    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0143  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  49.23 
 
 		 1196 aa  1056    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3905  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  64.39 
 
 		 1185 aa  1512    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4646  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.62 
 
 		 1191 aa  1469    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1762  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.29 
 
 		 1135 aa  972    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.614187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>