181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4599 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4599  acyltransferase 3  100 
 
 		 345 aa  670    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  29.36 
 
 		 695 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  32.33 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  30.53 
 
 		 632 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  29.28 
 
 		 598 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  26.2 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  27.25 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  29.21 
 
 		 637 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  27.03 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  29.5 
 
 		 665 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  30.62 
 
 		 695 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  27.24 
 
 		 667 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  27.41 
 
 		 658 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  31.43 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  26.59 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  29.1 
 
 		 679 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  32.45 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.32 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  28.35 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  28.95 
 
 		 629 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  30.46 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  27.64 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  26.79 
 
 		 625 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  27.01 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  28.68 
 
 		 645 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  28.32 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  31.43 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  36.57 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  28.95 
 
 		 647 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  27 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3551  acyltransferase 3  27.41 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  31.02 
 
 		 642 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  30.2 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.62 
 
 		 657 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  28.52 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  26.59 
 
 		 638 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  25.48 
 
 		 640 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  28.68 
 
 		 403 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  26.91 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  27.92 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  34.4 
 
 		 635 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4702  acyltransferase 3  26.43 
 
 		 336 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  30.51 
 
 		 392 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  29.93 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4389  acyltransferase 3  26.83 
 
 		 372 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  26.02 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3978  acyltransferase 3  26.83 
 
 		 372 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  28.89 
 
 		 401 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  28.02 
 
 		 404 aa  52.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.62 
 
 		 657 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  28.89 
 
 		 410 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  34.13 
 
 		 662 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  29.41 
 
 		 630 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25.63 
 
 		 660 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  25.75 
 
 		 660 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  27.12 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  21.47 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  28.73 
 
 		 675 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  24.83 
 
 		 561 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  26.77 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  26.37 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  27.72 
 
 		 583 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  26.37 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  28.89 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  31.36 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  26.71 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  32.69 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  31.95 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  25.89 
 
 		 673 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  26.15 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  26.85 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  28.57 
 
 		 410 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2190  acyltransferase 3  25.66 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  27.07 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  25.26 
 
 		 383 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  31.13 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  27.36 
 
 		 635 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  27.27 
 
 		 363 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.59 
 
 		 616 aa  49.7  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  26.09 
 
 		 409 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  34.26 
 
 		 381 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  33.06 
 
 		 660 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  28.68 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  28.95 
 
 		 629 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  31.15 
 
 		 671 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  26.99 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2107  acyltransferase 3  25.23 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.278583 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  27.27 
 
 		 660 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  29.21 
 
 		 684 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  27.72 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  33.65 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  26.72 
 
 		 656 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  33.04 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  25.59 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  28.41 
 
 		 683 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  27.44 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  24.74 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2149  acyltransferase 3  26.92 
 
 		 388 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.64 
 
 		 639 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>