More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3011 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 323 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  77.09 
 
 		 323 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  78.33 
 
 		 323 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  63.78 
 
 		 323 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  68.31 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  61.92 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  63.5 
 
 		 330 aa  361  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  57.89 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  56.97 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  56.35 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  56.04 
 
 		 325 aa  285  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  54.8 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  51.83 
 
 		 331 aa  258  9e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3978  thiamine-monophosphate kinase  54.77 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  decreased coverage  0.00138187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0658  thiamine-monophosphate kinase  50.62 
 
 		 323 aa  242  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0295042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4282  thiamine-monophosphate kinase  50.93 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0547325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  46.03 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  50 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  45.48 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  51.12 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  40.4 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  40.37 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  39.81 
 
 		 323 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  40.12 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  38.58 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  38.58 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  39.82 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  38.58 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  38.58 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  43.75 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  42.99 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  41.82 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  41.8 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  39.06 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  39.82 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  41.69 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  39.2 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  40.07 
 
 		 319 aa  188  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  38.72 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  38.72 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  38.53 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  39.7 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  36.96 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  41.08 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  41.08 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  41.08 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  42.64 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  41.08 
 
 		 326 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  42.28 
 
 		 324 aa  185  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  38.72 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  40.72 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  39.21 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2773  thiamine-monophosphate kinase  47.96 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  36.84 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  38.48 
 
 		 326 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  43.96 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  38.34 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  36.61 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  41.1 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  37.15 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  43.47 
 
 		 361 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  39.59 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  38.79 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  43.47 
 
 		 361 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  34.57 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  42.86 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  36.02 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  42.68 
 
 		 324 aa  176  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  42.6 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  42.6 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  42.6 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  42.6 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  42.6 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  35.87 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  42.6 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  42.6 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  39.39 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  39.39 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  39.39 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  41.28 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  33.54 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  39.39 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  41.28 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  39.39 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  39.39 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  43.43 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  41.54 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  43.29 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  40.94 
 
 		 325 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  42.73 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  36.96 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  40.9 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  40.85 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  45.02 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  43.21 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  38.16 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  40.6 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  40.6 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3043  thiamine-monophosphate kinase  44.05 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>