More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2859 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  89.22 
 
 		 208 aa  361  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  90.82 
 
 		 211 aa  349  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  78.64 
 
 		 202 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  74.52 
 
 		 208 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  79.79 
 
 		 203 aa  291  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  74.52 
 
 		 208 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  67.79 
 
 		 162 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  57.05 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  53.33 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  60.53 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  55.28 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  55.28 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  53.55 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1615  CinA domain protein  59.85 
 
 		 166 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  52.5 
 
 		 168 aa  161  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  60.14 
 
 		 175 aa  158  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  58.28 
 
 		 164 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  59.42 
 
 		 175 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  50.92 
 
 		 163 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  56.76 
 
 		 175 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  57.72 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  51.59 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  56.67 
 
 		 159 aa  147  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  51.92 
 
 		 163 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 162 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 162 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  52.74 
 
 		 166 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  55.71 
 
 		 140 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  50.62 
 
 		 162 aa  141  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1422  CinA domain-containing protein  53.25 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  53.25 
 
 		 178 aa  137  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  55.41 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  49.07 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  50.94 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  49.69 
 
 		 162 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  50.67 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0525  CinA domain protein  52.76 
 
 		 163 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  52.78 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  47.2 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  46.34 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  46.1 
 
 		 411 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  56.83 
 
 		 157 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  49.04 
 
 		 371 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  53.33 
 
 		 436 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  50 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  52.45 
 
 		 165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  48.95 
 
 		 164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  50.64 
 
 		 167 aa  131  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  56.52 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  54.01 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  45.45 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  43.92 
 
 		 169 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  48.92 
 
 		 164 aa  128  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1579  CinA-like protein  49.06 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0260319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  48.03 
 
 		 415 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  45.96 
 
 		 165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  45.96 
 
 		 165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  45.96 
 
 		 165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  45.96 
 
 		 165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  45.96 
 
 		 165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  45.96 
 
 		 165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  45.96 
 
 		 165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  48.7 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  45.57 
 
 		 166 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  48.61 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  45.57 
 
 		 166 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  48.61 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  45.96 
 
 		 165 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  48.61 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  47.44 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  47.92 
 
 		 165 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  51.3 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  47.4 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  48.37 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  48.61 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  45.99 
 
 		 362 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  47.92 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  43.48 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  54.07 
 
 		 422 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  55.45 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2173  CinA domain-containing protein  55.56 
 
 		 165 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19979  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  48.61 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  48.61 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  48.61 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  47.68 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  48.98 
 
 		 172 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  44.72 
 
 		 165 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  48.61 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  48.59 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  47.74 
 
 		 419 aa  122  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  52.59 
 
 		 430 aa  121  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  45.45 
 
 		 168 aa  121  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 166 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  45.16 
 
 		 165 aa  121  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  46.98 
 
 		 413 aa  121  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  47.92 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  45.45 
 
 		 413 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  45.83 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>