31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1099 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  100 
 
 
394 aa  786    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  65.82 
 
 
398 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  57.36 
 
 
394 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  60.43 
 
 
396 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  55.98 
 
 
393 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  60.9 
 
 
393 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  39.44 
 
 
390 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  36.01 
 
 
403 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  31.44 
 
 
394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  28.22 
 
 
400 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  27.11 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  26.12 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  34.2 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  34.07 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  34.07 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  25.19 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  37.67 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  26.34 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  25.42 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  23.84 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  33.55 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  32.16 
 
 
396 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  27.34 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  31.25 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  26.92 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  23.5 
 
 
419 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  21.88 
 
 
405 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  34.48 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  30.19 
 
 
403 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  23.03 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  28.57 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>