24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1122 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  100 
 
 		 406 aa  797    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  68.56 
 
 		 401 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  53.23 
 
 		 1159 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  50.27 
 
 		 793 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  58.02 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  55.22 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  57.58 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  54.77 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  43.92 
 
 		 433 aa  256  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  47.39 
 
 		 339 aa  236  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  35.29 
 
 		 4357 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  31.9 
 
 		 1597 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  31.5 
 
 		 1708 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  29.11 
 
 		 3907 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.54 
 
 		 6678 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.75 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1078  Laminin G sub domain 2  33.33 
 
 		 911 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.476778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1916 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  27.84 
 
 		 1577 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.16 
 
 		 2449 aa  46.6  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  28.3 
 
 		 786 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1699 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  33.82 
 
 		 1565 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.36 
 
 		 594 aa  42.7  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>