More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0158 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  49.69 
 
 		 968 aa  918    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  54.94 
 
 		 969 aa  976    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  49.95 
 
 		 968 aa  888    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41654  predicted protein  47.56 
 
 		 979 aa  919    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00193617  normal  0.306826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  49.9 
 
 		 964 aa  944    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  45.64 
 
 		 970 aa  837    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  87.71 
 
 		 968 aa  1754    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  49.95 
 
 		 1046 aa  953    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  35.34 
 
 		 992 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  36.45 
 
 		 973 aa  683    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  36.65 
 
 		 973 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  55.27 
 
 		 976 aa  1090    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  48.06 
 
 		 969 aa  896    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  100 
 
 		 968 aa  1966    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_232  predicted protein  42.41 
 
 		 986 aa  766    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  34.95 
 
 		 985 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  34.39 
 
 		 987 aa  528  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  33.13 
 
 		 987 aa  510  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  36.98 
 
 		 972 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1865  M16 family peptidase  30.82 
 
 		 1017 aa  491  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000469623  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  33.93 
 
 		 970 aa  469  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  32.51 
 
 		 1010 aa  469  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.02 
 
 		 973 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  34.04 
 
 		 985 aa  464  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1217  Peptidase M16C associated domain protein  34.02 
 
 		 999 aa  462  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00171078  normal  0.0476077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  31.67 
 
 		 983 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20700  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  33.37 
 
 		 972 aa  452  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  32.67 
 
 		 970 aa  452  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  33.3 
 
 		 1034 aa  449  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  32.06 
 
 		 975 aa  434  1e-120  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  33.65 
 
 		 967 aa  435  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  31.46 
 
 		 983 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.07 
 
 		 974 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  29.45 
 
 		 949 aa  399  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  30.44 
 
 		 1049 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  26.58 
 
 		 971 aa  381  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  29.94 
 
 		 1025 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  29.36 
 
 		 1024 aa  362  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  28.38 
 
 		 1032 aa  343  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  27.95 
 
 		 1046 aa  334  4e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  23.16 
 
 		 1137 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  23.39 
 
 		 1054 aa  144  8e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  31 
 
 		 1049 aa  118  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  22.27 
 
 		 1057 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  25.23 
 
 		 937 aa  94.7  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  24.25 
 
 		 945 aa  84.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  23.88 
 
 		 896 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  26.64 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  28.73 
 
 		 928 aa  79  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  27.06 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3614  peptidase M16 domain protein  27.22 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  26.4 
 
 		 431 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  29.19 
 
 		 878 aa  75.5  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  23.95 
 
 		 919 aa  75.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  25.96 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  25.96 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  28.46 
 
 		 457 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  28.46 
 
 		 441 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  25.57 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  26.53 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1020  peptidase M16 domain protein  24.48 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  25.15 
 
 		 912 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  25.22 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  27.69 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  27.38 
 
 		 868 aa  69.3  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  24.71 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  28.11 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  28.52 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  26.11 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  26.78 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2341  peptidase M16-like  26.27 
 
 		 426 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  26.03 
 
 		 937 aa  66.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  25 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  24.29 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  26.33 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  26.24 
 
 		 949 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  23.56 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  24.56 
 
 		 942 aa  65.1  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  25.7 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  24.41 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  25.44 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  22.5 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  26.59 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  20.93 
 
 		 419 aa  64.3  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  24.23 
 
 		 440 aa  63.9  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  26.52 
 
 		 879 aa  63.9  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  22.41 
 
 		 443 aa  64.3  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  23.9 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1365  peptidase M16 domain-containing protein  29.67 
 
 		 428 aa  63.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1339  peptidase M16 domain-containing protein  29.67 
 
 		 428 aa  63.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  26.2 
 
 		 921 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  26.98 
 
 		 927 aa  63.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  23.12 
 
 		 443 aa  63.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  24.16 
 
 		 948 aa  63.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  27.57 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  24.53 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0766  peptidase M16 domain protein  25.68 
 
 		 426 aa  62  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.227787  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  26.76 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  24.63 
 
 		 957 aa  62  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  22.82 
 
 		 443 aa  62  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>