More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6260 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  70.46 
 
 		 518 aa  773    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  67.89 
 
 		 517 aa  747    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  72.53 
 
 		 516 aa  769    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  70.46 
 
 		 518 aa  773    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 517 aa  1073    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  72.53 
 
 		 516 aa  769    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  70.46 
 
 		 518 aa  773    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  57.06 
 
 		 512 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  55.71 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  55.71 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  55.71 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  56.67 
 
 		 505 aa  589  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  54.74 
 
 		 514 aa  579  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  54.71 
 
 		 507 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  54.14 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  54.14 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  54.14 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  53.95 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  54.14 
 
 		 513 aa  544  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 		 513 aa  544  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 		 513 aa  544  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  53.47 
 
 		 513 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  51.73 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  51.73 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  51.73 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  51.92 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  51.73 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  51.73 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  51.73 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 514 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  51.54 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 514 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 		 514 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  52.22 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  50.39 
 
 		 504 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  48.66 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  51.15 
 
 		 523 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 525 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 		 475 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  47.6 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  47.6 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  47.6 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 513 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  47.58 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  49.51 
 
 		 510 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  45.58 
 
 		 513 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  47.32 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  47.32 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  47.32 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  47.32 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  44.1 
 
 		 510 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  44.1 
 
 		 510 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  44.1 
 
 		 510 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  44.1 
 
 		 510 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  50.21 
 
 		 487 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  47.13 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  44.21 
 
 		 528 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  43.82 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  41.02 
 
 		 517 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  42.17 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  45.94 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  40.9 
 
 		 507 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  40.9 
 
 		 507 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  39.81 
 
 		 513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 		 518 aa  353  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  37.33 
 
 		 519 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  37.33 
 
 		 519 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  37.33 
 
 		 519 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  43.19 
 
 		 432 aa  332  9e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  45.09 
 
 		 472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  39.84 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  31.74 
 
 		 515 aa  276  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0052  Integrase catalytic region  34.26 
 
 		 521 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0148  Integrase catalytic region  34.26 
 
 		 520 aa  266  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1596  Integrase catalytic region  33.46 
 
 		 512 aa  262  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.151594  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  48.21 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  31.69 
 
 		 524 aa  249  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  31.69 
 
 		 524 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  31.69 
 
 		 524 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  31.69 
 
 		 524 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  45.88 
 
 		 539 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  31.2 
 
 		 526 aa  229  8e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3122  hypothetical protein  38.3 
 
 		 316 aa  223  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>