76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5881 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  228  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  78.95 
 
 		 114 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  67.31 
 
 		 120 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  67.31 
 
 		 120 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  62.86 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  58.49 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  61.06 
 
 		 122 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3391  hypothetical protein  63.89 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  0.0862891 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  57.28 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  54.72 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  51.85 
 
 		 505 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  55.88 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  54.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  53.06 
 
 		 99 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  53.06 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  55.1 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  53 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4170  hypothetical protein  52.04 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1938  hypothetical protein  46.6 
 
 		 108 aa  96.7  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000407914  normal  0.0922297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  46.67 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0824  hypothetical protein  52.53 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  48.57 
 
 		 590 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4148  hypothetical protein  45.92 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1228  hypothetical protein  47.96 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  47.52 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  47.52 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  54.55 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17110  hypothetical protein  43.4 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118524  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3736  hypothetical protein  52.48 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4092  hypothetical protein  47.52 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4813  hypothetical protein  52.48 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.927854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  47.62 
 
 		 590 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  44.66 
 
 		 603 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  45.54 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6326  hypothetical protein  46.53 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.681991 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1369  hypothetical protein  45.54 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.775913  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  44.55 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0887  hypothetical protein  45.54 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  44 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1347  hypothetical protein  44.55 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0599686 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  44.44 
 
 		 599 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  42.45 
 
 		 598 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  40.19 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  42 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  39.25 
 
 		 612 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2674  hypothetical protein  47.83 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.147046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  40.74 
 
 		 627 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  42.57 
 
 		 616 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  39.05 
 
 		 608 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  42.39 
 
 		 571 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18510  hypothetical protein  37.84 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  33.93 
 
 		 600 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  33.93 
 
 		 600 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  35.45 
 
 		 596 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  34.51 
 
 		 587 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  37.04 
 
 		 607 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  36.28 
 
 		 580 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  36.08 
 
 		 619 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  36 
 
 		 578 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  33.01 
 
 		 588 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3667  hypothetical protein  36.19 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.628036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  34 
 
 		 562 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  33.33 
 
 		 587 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  33 
 
 		 570 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 562 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  31.18 
 
 		 561 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  31.25 
 
 		 581 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  31.18 
 
 		 596 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  28.28 
 
 		 578 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  27.84 
 
 		 560 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  31.07 
 
 		 596 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  32.14 
 
 		 575 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  32.14 
 
 		 575 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  32.14 
 
 		 575 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  26.26 
 
 		 594 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  29.7 
 
 		 584 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>