More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5545 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 352 aa  706    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  43.75 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  43.75 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.6 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  42.3 
 
 		 355 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.18 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  43.59 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 		 350 aa  259  4e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  40.57 
 
 		 357 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 		 349 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2474  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 		 352 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3477  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.8 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2972  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.08 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679689  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3825  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  38.22 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.23 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.97 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.89 
 
 		 346 aa  162  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.75 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.17 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.92 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.68 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.5 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.37 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 		 346 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.14 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.65 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  30.66 
 
 		 348 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.05 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  33.72 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.43 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.01 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.39 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.73 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.76 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.02 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.79 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.02 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 		 343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.71 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.62 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.11 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.29 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.86 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.34 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.65 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.21 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.46 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 		 338 aa  125  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.23 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.34 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1660  alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1696  alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2090  alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  30.11 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>