31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4703 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  63.33 
 
 		 164 aa  197  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  41.27 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  44.14 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  43.15 
 
 		 270 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  39.76 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  40.24 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  36.05 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  36.05 
 
 		 176 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  38.75 
 
 		 192 aa  111  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  38.93 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  45.67 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  43.36 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  38.56 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  38.36 
 
 		 168 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  41.13 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  41.94 
 
 		 264 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  38.41 
 
 		 160 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  37.66 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  34.04 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  34.48 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  32.84 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  33.52 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  34.39 
 
 		 154 aa  72  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  29.81 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  31.78 
 
 		 314 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  26.85 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 124 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  28.67 
 
 		 172 aa  41.2  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>