More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2924 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.04 
 
 		 473 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  65.33 
 
 		 474 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  80.64 
 
 		 472 aa  786    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.21 
 
 		 485 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.48 
 
 		 474 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  77.83 
 
 		 471 aa  773    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  74.72 
 
 		 469 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  90.04 
 
 		 476 aa  878    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  78.94 
 
 		 472 aa  783    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  76.12 
 
 		 469 aa  754    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  74.72 
 
 		 469 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.91 
 
 		 469 aa  752    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  74.72 
 
 		 469 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  76.12 
 
 		 469 aa  752    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.96 
 
 		 474 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  74.72 
 
 		 469 aa  709    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  74.72 
 
 		 469 aa  709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  75.28 
 
 		 469 aa  720    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.32 
 
 		 469 aa  742    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  64.83 
 
 		 473 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  77.61 
 
 		 471 aa  772    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  66.3 
 
 		 499 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 		 495 aa  1013    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  76.5 
 
 		 452 aa  736    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  74.72 
 
 		 469 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.83 
 
 		 470 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  78.94 
 
 		 472 aa  781    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.32 
 
 		 469 aa  742    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  74.72 
 
 		 469 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.69 
 
 		 469 aa  751    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  65.14 
 
 		 474 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 474 aa  625  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  66.74 
 
 		 474 aa  623  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.77 
 
 		 473 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  68.45 
 
 		 462 aa  613  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.38 
 
 		 488 aa  584  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.91 
 
 		 467 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.61 
 
 		 477 aa  556  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  59.82 
 
 		 457 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  62.5 
 
 		 464 aa  554  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.82 
 
 		 457 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  60.59 
 
 		 472 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  58.32 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.39 
 
 		 470 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.85 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.55 
 
 		 475 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  58.07 
 
 		 456 aa  542  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.68 
 
 		 457 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1410  oxidoreductase, FAD-binding  58.07 
 
 		 468 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  58.53 
 
 		 473 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.31 
 
 		 492 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.83 
 
 		 474 aa  532  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1366  oxidoreductase, FAD-binding  57.85 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.866723  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  58.19 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  58.19 
 
 		 497 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  58.19 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  58.19 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  58.19 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  58.19 
 
 		 497 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2807  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.4 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  57.96 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  57.05 
 
 		 460 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.84 
 
 		 460 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2548  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.95 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  57.36 
 
 		 475 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.58 
 
 		 475 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  57.08 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1361  D-lactate dehydrogenase  56.25 
 
 		 468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.93 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  57.56 
 
 		 472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  55.53 
 
 		 469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  55.02 
 
 		 478 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.53 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  55.48 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.28 
 
 		 459 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.57 
 
 		 457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.25 
 
 		 482 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  50.23 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  50 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  50.23 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  49.77 
 
 		 463 aa  455  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  50 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  50 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.87 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  49.89 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  49.21 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  49.21 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.01 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0144  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.33 
 
 		 450 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  48.1 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  45.58 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.12 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  47.11 
 
 		 453 aa  412  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  45.78 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  45.87 
 
 		 601 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2410  FAD linked oxidase-like  47.54 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_55040  d-lactate dehydrogenase  41.85 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  45.5 
 
 		 560 aa  360  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  43.18 
 
 		 565 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.8 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>