182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1844 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  100 
 
 		 173 aa  353  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  90.17 
 
 		 173 aa  307  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  56.47 
 
 		 180 aa  204  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  61.31 
 
 		 172 aa  200  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  58.08 
 
 		 174 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  56.89 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  55.36 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  55.36 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  55.36 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  55.36 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  55.36 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  55.95 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  55.95 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  55.36 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  55.36 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  55.36 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  55.36 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  55.36 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  55.36 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  54.76 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  56.29 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  55.36 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  54.6 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  52.35 
 
 		 173 aa  191  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  53.89 
 
 		 167 aa  191  6e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  56.44 
 
 		 173 aa  188  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  57.4 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  58.64 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  52.94 
 
 		 175 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  52.35 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  51.74 
 
 		 174 aa  184  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  55.88 
 
 		 190 aa  182  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  56.21 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  54.71 
 
 		 177 aa  180  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  56.21 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  53.25 
 
 		 188 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  55.56 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  50.58 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  54.94 
 
 		 174 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  53.5 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  56.29 
 
 		 174 aa  177  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  52.38 
 
 		 171 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  55.69 
 
 		 174 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  55.69 
 
 		 174 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  55.42 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  54.12 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  52.94 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  52.38 
 
 		 171 aa  175  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  51.79 
 
 		 170 aa  175  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  54.49 
 
 		 174 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  53.99 
 
 		 174 aa  172  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  53.29 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  53.33 
 
 		 173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  52.69 
 
 		 180 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  51.79 
 
 		 186 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  58.39 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  50.89 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  52.15 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  51.85 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  53.42 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  51.22 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  49.7 
 
 		 184 aa  164  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  54.71 
 
 		 171 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  52.69 
 
 		 175 aa  165  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  55.03 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  55.15 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  52.12 
 
 		 181 aa  164  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  43.86 
 
 		 176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  49.11 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  52.69 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  50.63 
 
 		 183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  56.95 
 
 		 192 aa  160  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  52.94 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  50.59 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  53.57 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  52.98 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  51.25 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  47.06 
 
 		 180 aa  157  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  47.88 
 
 		 173 aa  157  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  51.53 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  48.82 
 
 		 195 aa  156  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.82 
 
 		 599 aa  155  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  49.68 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  45.88 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  50.98 
 
 		 186 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.24 
 
 		 599 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  50.91 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  53.29 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  52.17 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  48.8 
 
 		 190 aa  151  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  47.93 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  56.06 
 
 		 176 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0164  Appr-1-p processing domain protein  46.67 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.322732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  50.9 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  48.5 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  54.17 
 
 		 177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  46.47 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  50.93 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  48.78 
 
 		 188 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  48.78 
 
 		 188 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>