More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0975 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  80.75 
 
 
213 aa  367  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  66.82 
 
 
218 aa  287  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  65.09 
 
 
217 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  66.04 
 
 
217 aa  279  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.74 
 
 
214 aa  277  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.32 
 
 
220 aa  272  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  52.17 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  52.75 
 
 
218 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.16 
 
 
224 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  51.16 
 
 
218 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.16 
 
 
218 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.16 
 
 
218 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.16 
 
 
218 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  51.16 
 
 
218 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
215 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.84 
 
 
218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  50.7 
 
 
218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  53.02 
 
 
218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  51.21 
 
 
215 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  51.66 
 
 
218 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  51.18 
 
 
218 aa  207  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  51.18 
 
 
218 aa  207  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  51.18 
 
 
218 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.49 
 
 
210 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.15 
 
 
218 aa  191  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  45.37 
 
 
224 aa  174  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.45 
 
 
220 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.97 
 
 
220 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.92 
 
 
220 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  45.5 
 
 
220 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  42.31 
 
 
219 aa  158  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.28 
 
 
225 aa  144  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  37.5 
 
 
225 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  28.83 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  28.1 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.82 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  30.58 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.9 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  29.36 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  30.12 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.16 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  28.82 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  27.96 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.33 
 
 
228 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  27.96 
 
 
260 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  30.18 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.13 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  29.85 
 
 
391 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  31.37 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  28.82 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2348  glutathione S-transferase-like protein  29.08 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626345  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.18 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  28.99 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  31.63 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  27.8 
 
 
222 aa  58.9  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  30.99 
 
 
202 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  25.11 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  28.99 
 
 
202 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  30.56 
 
 
243 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  27.81 
 
 
226 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.74 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.25 
 
 
217 aa  58.2  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  26.54 
 
 
203 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  29.07 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3898  putative glutathione S-transferase  30.12 
 
 
202 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  26.54 
 
 
203 aa  58.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.86 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  30.23 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  26.88 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  30.88 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  29.95 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1076  glutathione S-transferase  27.84 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.079186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.65 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.07 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.07 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  28.24 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  29.27 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  29.07 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  31.74 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.67 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  26.42 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  27.5 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1522  Glutathione S-transferase domain protein  29.63 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  27.85 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  26.58 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.58 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.58 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.89 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  26.58 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.58 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.58 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.58 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  30.49 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.31 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  28.31 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  27.04 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>