39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2273 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  35.79 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  37.54 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  33.1 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  32.07 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  31.84 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  29.31 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.21 
 
 		 445 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.71 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  29.7 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  28.94 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  28.94 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  27.2 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  30.83 
 
 		 642 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  26.67 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  30.6 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  30.6 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  24.07 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0066  putative ATP/GTP-binding protein  29.95 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.31 
 
 		 930 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2603  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  27.66 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776475  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2463  periplasmic ATP/GTP-binding protein  24.52 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  28.9 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  28.81 
 
 		 831 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  29.7 
 
 		 346 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.5 
 
 		 930 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  32.3 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  34.86 
 
 		 676 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25.84 
 
 		 752 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  28.19 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  29.87 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  28.93 
 
 		 579 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  27.65 
 
 		 668 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  24.89 
 
 		 700 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  36.46 
 
 		 1030 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  27.42 
 
 		 888 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.28 
 
 		 1292 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.3 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>