15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0066 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0066  putative ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  29.29 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  86.3  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  27.75 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  27.51 
 
 		 642 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  30.36 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  30.36 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.54 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  27.31 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  25.3 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  24.81 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2463  periplasmic ATP/GTP-binding protein  24.84 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  33.1 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  26.56 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>