21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0124 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 278 aa  547  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  59.7 
 
 		 283 aa  299  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  59.7 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  33.33 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0066  putative ATP/GTP-binding protein  29.92 
 
 		 304 aa  99.4  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  30.58 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.04 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2463  periplasmic ATP/GTP-binding protein  26.2 
 
 		 311 aa  89.7  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  30.86 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  29.01 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  29.01 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  32.95 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  33.33 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  28.81 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  30.24 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  26.05 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1289  putative periplasmic ATP/GTP-binding protein  48.44 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0256808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.34 
 
 		 445 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  29.23 
 
 		 642 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  24.45 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  26.56 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>