More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1146 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1146  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
414 aa  827    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00446094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  31.44 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
819 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.02 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  26.15 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
467 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
812 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  23.89 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  30.27 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  25.16 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
1261 aa  69.7  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  32.95 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  26.33 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  28.11 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
816 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  27.88 
 
 
816 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.85 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.12 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49124  predicted protein  26.27 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469563  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  26.92 
 
 
428 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
385 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
399 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  27.49 
 
 
421 aa  67  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.09 
 
 
410 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1026  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  30.51 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25.71 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.1 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  27.06 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
360 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.33 
 
 
490 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.37 
 
 
375 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.33 
 
 
490 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05710  glycosyltransferase  29.76 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  28.82 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
448 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
446 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02930  glycosyltransferase  31.68 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.94 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
360 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30.81 
 
 
403 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
385 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.06 
 
 
383 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.12 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
416 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  25.12 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
352 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  23.22 
 
 
366 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.21 
 
 
935 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>