More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6089 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  100 
 
 		 334 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  64.71 
 
 		 325 aa  381  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  40.55 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  46.92 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  43.62 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  41.81 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  41.69 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  41.69 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  40.2 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  41.5 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  41.5 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  41.5 
 
 		 311 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  41.5 
 
 		 311 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  41.99 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  38.18 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  38.18 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  41.16 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  42.32 
 
 		 310 aa  206  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  41.16 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  41.16 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 		 334 aa  205  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 		 334 aa  205  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  41.78 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  41.16 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  39.25 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  38.77 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 		 346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  40.98 
 
 		 346 aa  199  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  40.64 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  38.25 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.86 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  38.57 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  38.86 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.18 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.39 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  40.07 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  37.88 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.45 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  37.58 
 
 		 338 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  40.94 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  41.55 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  38.15 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  38.02 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  40.79 
 
 		 322 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  36.65 
 
 		 353 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  38.46 
 
 		 327 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  41.81 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  38.74 
 
 		 322 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  37.46 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  41.52 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  37.99 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  37.54 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  38.43 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  38.58 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 355 aa  189  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  36.67 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  39.24 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  38.31 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  37.97 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  37.97 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  38.8 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  38.8 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  38.8 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  38.8 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  39.1 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0561  inner-membrane translocator  41.36 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  41.64 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  38.8 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  38.8 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  38.8 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  41.61 
 
 		 322 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  39.08 
 
 		 333 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 		 332 aa  186  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  38.8 
 
 		 329 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  38.03 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  38.8 
 
 		 329 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  40.97 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  37.54 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  34.14 
 
 		 329 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  37.99 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  37.77 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2474  L-arabinose transporter permease protein  37.46 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.552924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  34.14 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.98 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  42.05 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  37.16 
 
 		 342 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  40.54 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>