More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5974 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_5974  inner-membrane translocator  100 
 
 		 339 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6461  inner-membrane translocator  93.81 
 
 		 339 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0887311  normal  0.300113 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5168  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  73.72 
 
 		 349 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43600  AraH family inner-membrane translocator  56.46 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.822717  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2368  ABC sugar (ribose) transporter, inner membrane subunit  56.05 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.163977  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1028  inner-membrane translocator  56.05 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2760  ribose transport permease protein, putative  59.66 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.792455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2993  inner-membrane translocator  59.66 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2875  inner-membrane translocator  52.76 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966602  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4171  inner-membrane translocator  51.46 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2994  ribose ABC transporter, permease protein, putative  53.56 
 
 		 334 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3307  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1424  carbohydrate ABC transporter permease  53.23 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0022  ribose transport system permease protein RbsC, internal deletion  53.23 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1511  carbohydrate ABC transporter permease  53.23 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2722  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  30.5 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  30.5 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 835 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.54 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.05 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  34.44 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.73 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.73 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.73 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.73 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  31 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  30.32 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  29.7 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  32.04 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  29.7 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.05 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  29.19 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  28.17 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  27.62 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.44 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  32.53 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  29.39 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  29.72 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  31.09 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  30.45 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  29.18 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  30.62 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  29.56 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  32.42 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  28.75 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  28.76 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.12 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  29.91 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6163  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000865468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  28.05 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  30.82 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  30.72 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  31.05 
 
 		 322 aa  99.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  30.22 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  30.22 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 309 aa  99.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2721  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.94 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  29.1 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  29.22 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  30.72 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3057  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  29.45 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  29.88 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1178.1  ribose transport system permease protein RbsC, internal deletion  50 
 
 		 200 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.744822  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  30.31 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  30.31 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  30.31 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  29.7 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>