44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4787 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  100 
 
 		 176 aa  350  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  87.5 
 
 		 176 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  37.5 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  35.67 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  33.52 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  33.14 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  35.84 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  28.57 
 
 		 185 aa  99  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  30.81 
 
 		 189 aa  98.2  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  32.96 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  33.14 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  32.03 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  33.33 
 
 		 204 aa  84.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  30.53 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  27.98 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  28.98 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  27.46 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  29.19 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  23.84 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  27.68 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  27.37 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  28.99 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  31.4 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  26.44 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  24.28 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  22.94 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  22.94 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  27.04 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  26.53 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  25.95 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  21.18 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  35.53 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2268  hypothetical protein  26.01 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.771496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  34.57 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  32.79 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  24.39 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  27.59 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5225  TadE family protein  31.82 
 
 		 240 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  24.39 
 
 		 168 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  47.5 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  31.97 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  24.39 
 
 		 722 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2081  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.46 
 
 		 714 aa  41.2  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0369235  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2169  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.46 
 
 		 714 aa  41.2  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.184355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>