More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3384 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
360 aa  708    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.36 
 
 
349 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4039  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  58.36 
 
 
349 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3552  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease protein  58.36 
 
 
349 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.52 
 
 
340 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.19 
 
 
352 aa  361  8e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.239018  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.28 
 
 
350 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.85 
 
 
356 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.85 
 
 
356 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00157663  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.06 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.09 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.076951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.65 
 
 
383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  50 
 
 
355 aa  335  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.7 
 
 
346 aa  335  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.29 
 
 
356 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.89 
 
 
352 aa  335  9e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.58 
 
 
352 aa  335  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0522734  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.98 
 
 
356 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0210654  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.4 
 
 
352 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.15 
 
 
358 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.29 
 
 
356 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.61 
 
 
356 aa  332  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1252  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  53.29 
 
 
356 aa  332  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.95 
 
 
333 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1443  ABC transporter, permease protein  52.98 
 
 
330 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0196  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  50.58 
 
 
356 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0448682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.78 
 
 
346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0835992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.01 
 
 
346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.73 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.01 
 
 
355 aa  325  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.857231 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.24 
 
 
336 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 
355 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1275  ABC transporter, permease protein  52.83 
 
 
336 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.572487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1049  ABC transporter, permease protein  52.83 
 
 
356 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1391  ABC transporter, permease protein  52.83 
 
 
356 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0350688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1310  ABC transporter, permease protein  52.83 
 
 
356 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0248  ABC transporter, permease protein  52.83 
 
 
356 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0519  ABC transporter, permease protein  52.83 
 
 
356 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2561  ABC transporter, permease protein  52.52 
 
 
356 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.61 
 
 
356 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.44 
 
 
355 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.34 
 
 
356 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0806  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppB  51.34 
 
 
356 aa  322  6e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.557497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.77 
 
 
347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.97 
 
 
347 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0789045  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1029  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.29 
 
 
357 aa  317  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.234633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 
365 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.09 
 
 
351 aa  315  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100967  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.79 
 
 
336 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.89 
 
 
356 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.12 
 
 
369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166157  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.02 
 
 
342 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162218  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.72 
 
 
342 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240236  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 
337 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.14 
 
 
345 aa  299  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.33 
 
 
345 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3249  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB, putative  51.01 
 
 
345 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0957202  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0800  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.85 
 
 
356 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
365 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285903  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.79 
 
 
338 aa  268  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
364 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582701  hitchhiker  0.00744073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  42.77 
 
 
336 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  42.77 
 
 
336 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  44.05 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  42.77 
 
 
336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  42.77 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
335 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  43.03 
 
 
336 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.92 
 
 
336 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
334 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  44.05 
 
 
336 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  43.09 
 
 
336 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  42.44 
 
 
336 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  39.39 
 
 
339 aa  247  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  41.8 
 
 
334 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.8 
 
 
336 aa  245  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  42.55 
 
 
337 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.48 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.06 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
336 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
335 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.84 
 
 
335 aa  242  9e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  43.21 
 
 
336 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 
334 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 
336 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 
334 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 
337 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.678107  normal  0.316578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.72 
 
 
336 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  41.03 
 
 
337 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.84 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  40.19 
 
 
335 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  42.44 
 
 
336 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  41.16 
 
 
336 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.48 
 
 
336 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  41.43 
 
 
337 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  41.16 
 
 
336 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  40.71 
 
 
339 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  40.06 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>