117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0726 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0726  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 122 aa  249  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0709  transposase IS3/IS911 family protein  61.72 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.668336  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  48.19 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  31.39 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  31.39 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  39.37 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  34.15 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  32.58 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  35.37 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  30.17 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  38.03 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  38.03 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  29.81 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  34.34 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  27.34 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  27.34 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  27.34 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  29.2 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  36.23 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  30.53 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  30.53 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  30.53 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  36.36 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  35.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  30 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  30.88 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  30.88 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  30.88 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  30.88 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  30.88 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  30.88 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  26.24 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  41.67 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  34.72 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  29.27 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  29.27 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  29.27 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  29.27 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  29.27 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  29.27 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  29.27 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  30.51 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  30.51 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3339  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  26.77 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  32.84 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  32.84 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  32.84 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  32.84 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  32.84 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  32.84 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  25.19 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  33.93 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  31.76 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  31.76 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  26.98 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  26.98 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  26.98 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  28.12 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  28.12 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  27.42 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  28.7 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  27.84 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1804  transposase IS3/IS911 family protein  29.66 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  30.23 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  27.37 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  36.51 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>