27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5600 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  30.64 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  29.55 
 
 
313 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  28.79 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  29.11 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  28.35 
 
 
350 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  29.35 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  24.16 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  27.63 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  28.71 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  27.08 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  22.44 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  24.43 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  24.43 
 
 
359 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  28.3 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  25.33 
 
 
320 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  27.07 
 
 
338 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  25.47 
 
 
289 aa  52.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  27.2 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1527  hypothetical protein  27.14 
 
 
188 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  25.96 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  32.18 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  25.4 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  26.09 
 
 
344 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  20.43 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  22.92 
 
 
281 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  25.71 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>