More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5519 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5519  threonine dehydratase  100 
 
 		 333 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0114285 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5240  threonine dehydratase  85.54 
 
 		 333 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3695  threonine dehydratase  75.68 
 
 		 334 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3469  threonine dehydratase  64.44 
 
 		 324 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  60.38 
 
 		 323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0285  threonine dehydratase  64.98 
 
 		 318 aa  352  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.832074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  59.56 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  59.56 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  57.37 
 
 		 330 aa  348  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4430  threonine dehydratase  57.14 
 
 		 330 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  60.5 
 
 		 323 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  60.5 
 
 		 323 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  57.59 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4376  ectoine utilization protein EutB  60.25 
 
 		 325 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  60.5 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3175  threonine dehydratase  62.81 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.465407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2151  threonine dehydratase  59.05 
 
 		 319 aa  302  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme beta subunit  49.01 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2723  threonine dehydratase  50.87 
 
 		 331 aa  243  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  42.14 
 
 		 403 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  36.79 
 
 		 403 aa  222  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  44.03 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.18 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  43.4 
 
 		 403 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  42.14 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  42.14 
 
 		 403 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  41.04 
 
 		 402 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  40.78 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  41.77 
 
 		 401 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  41.77 
 
 		 401 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  40.99 
 
 		 404 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  40.81 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  39.81 
 
 		 403 aa  196  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  36.36 
 
 		 402 aa  195  9e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.94 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  40 
 
 		 506 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  36.54 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  40 
 
 		 506 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  35.37 
 
 		 403 aa  192  5e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  35.69 
 
 		 403 aa  192  9e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  39.1 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  34.6 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  36.79 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10990  threonine dehydratase  43.26 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.02 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  40.82 
 
 		 418 aa  189  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  38.8 
 
 		 501 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  39.68 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  35.05 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  35.53 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  39.34 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  34.29 
 
 		 402 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  35.05 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  39.61 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  36.57 
 
 		 400 aa  186  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  41.16 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  38.98 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  38.98 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  36.71 
 
 		 514 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  36.71 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  36.36 
 
 		 401 aa  185  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  41.58 
 
 		 412 aa  185  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  40.82 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  36.05 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  41.04 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  40.72 
 
 		 404 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  40.69 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  38.17 
 
 		 504 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  39.87 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  41.64 
 
 		 412 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.17 
 
 		 504 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3564  threonine dehydratase  39.05 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  38.78 
 
 		 411 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  38.66 
 
 		 403 aa  182  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  39.03 
 
 		 400 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  39.48 
 
 		 512 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2325  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.61 
 
 		 333 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  35.76 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3301  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.69 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0872906  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  42.49 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.04 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  39.68 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  41.48 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0008  hypothetical protein  35.44 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  38.26 
 
 		 520 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2761  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.69 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0379414  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  35.44 
 
 		 320 aa  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  37.3 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.06 
 
 		 522 aa  179  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  41.37 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  39.77 
 
 		 413 aa  178  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2731  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.69 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437553  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2775  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.69 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2122  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.54 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113848  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  33.75 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  39.03 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  37.42 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  36.68 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  36.68 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  34.74 
 
 		 511 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>