More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4479 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1110  ABC transporter related  64.85 
 
 		 520 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434413  normal  0.608996 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6451  ABC transporter related  93.41 
 
 		 516 aa  953    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0328742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1706  ABC transporter related  64.59 
 
 		 520 aa  673    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.76456 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4479  ABC transporter related  100 
 
 		 516 aa  1045    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2025  ABC transporter related  64.79 
 
 		 520 aa  674    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5652  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  74.8 
 
 		 508 aa  771    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.027963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4624  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.09 
 
 		 509 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229376 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5239  ABC transporter related  54.86 
 
 		 536 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1372  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  55.08 
 
 		 537 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0849  ABC transporter related protein  53.05 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0765  ABC transporter  53.2 
 
 		 534 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1355  ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 		 511 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1164  ABC transporter  53.69 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.345716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0274  ABC transporter related  51.56 
 
 		 532 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0840  ABC transporter related  49.33 
 
 		 572 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3022  ABC transporter-related protein  50.09 
 
 		 559 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  38.36 
 
 		 513 aa  333  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  38.95 
 
 		 520 aa  330  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38 
 
 		 512 aa  323  5e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  37.35 
 
 		 525 aa  323  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  35.7 
 
 		 491 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  36.25 
 
 		 518 aa  317  3e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  35.73 
 
 		 509 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  37.13 
 
 		 527 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.32 
 
 		 511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  34.44 
 
 		 515 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  38.8 
 
 		 516 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  36.78 
 
 		 545 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  39.3 
 
 		 533 aa  312  7.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  35.57 
 
 		 510 aa  312  9e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  37.2 
 
 		 505 aa  312  9e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  38.05 
 
 		 533 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  35.93 
 
 		 508 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  36.83 
 
 		 551 aa  310  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.67 
 
 		 508 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 510 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 523 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.04 
 
 		 506 aa  309  8e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 510 aa  309  9e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 510 aa  309  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 510 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.53 
 
 		 510 aa  309  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  37.37 
 
 		 527 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  35.52 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  36.14 
 
 		 524 aa  307  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 510 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  36.42 
 
 		 604 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  36.45 
 
 		 518 aa  307  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 510 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  37.4 
 
 		 504 aa  305  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  38.63 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  34.78 
 
 		 520 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  34.21 
 
 		 510 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  36.61 
 
 		 548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3655  ABC transporter related  37.82 
 
 		 509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  36.08 
 
 		 547 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 		 522 aa  303  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  34.33 
 
 		 510 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.9 
 
 		 528 aa  302  7.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  37.1 
 
 		 529 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  37.01 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  33.53 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3673  ABC transporter related  34.42 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  34.93 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  38.35 
 
 		 498 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  35.04 
 
 		 509 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 		 535 aa  301  3e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 507 aa  300  6e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  36.24 
 
 		 511 aa  299  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  36.9 
 
 		 532 aa  299  9e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 		 534 aa  299  9e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  37.03 
 
 		 501 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  35.86 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  36.26 
 
 		 515 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  35.61 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  37.65 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  36.27 
 
 		 517 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0636  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  36.06 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4442  ABC transporter related  37.53 
 
 		 523 aa  296  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  34.91 
 
 		 509 aa  296  6e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  36.48 
 
 		 533 aa  296  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  37.38 
 
 		 533 aa  295  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1529  ABC transporter related  33.87 
 
 		 513 aa  295  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0006  ABC transporter, ATP-binding protein  37.53 
 
 		 523 aa  295  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 		 511 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 		 511 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  36.7 
 
 		 509 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  37.07 
 
 		 534 aa  294  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  35.24 
 
 		 518 aa  294  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1498  ATPase  35.67 
 
 		 513 aa  293  4e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  35.02 
 
 		 528 aa  293  5e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  34.65 
 
 		 509 aa  293  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  34.27 
 
 		 510 aa  293  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  35.92 
 
 		 517 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  36.31 
 
 		 527 aa  293  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0993  ABC transporter related  34.19 
 
 		 517 aa  293  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>