More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4290 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  90.45 
 
 		 157 aa  276  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  82.17 
 
 		 157 aa  256  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  75.8 
 
 		 157 aa  245  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  71.34 
 
 		 157 aa  234  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  77.71 
 
 		 157 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  71.97 
 
 		 157 aa  230  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  76.6 
 
 		 157 aa  228  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  76.76 
 
 		 157 aa  227  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  73.89 
 
 		 157 aa  225  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  67.31 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  69.43 
 
 		 158 aa  216  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  69.28 
 
 		 166 aa  216  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  70.06 
 
 		 158 aa  213  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  72.54 
 
 		 157 aa  210  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.54 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1391  ybaK/ebsC protein  66.89 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  60.43 
 
 		 157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  55.48 
 
 		 158 aa  163  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  45.03 
 
 		 165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  50 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  43.54 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  49.67 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  48.34 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  45.45 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  44.08 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  44.6 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  39.86 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  42.38 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  43.17 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  48.2 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  47.33 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  43.87 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  41.1 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  45.27 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1664  ybaK/ebsC protein  44.44 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  47.3 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  47.3 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  43.05 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  45.95 
 
 		 166 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  45.64 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  43.59 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  44.74 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  45.59 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  41.22 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  45.59 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  40.27 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  41.61 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  43.62 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  42.18 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4688  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.38 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80799  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  44.08 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  42.95 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  43.62 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  43.15 
 
 		 163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  39.61 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3500  ybaK/ebsC protein  42.76 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00301765  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  39.6 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  39.6 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  39.6 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  39.6 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  41.03 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  39.6 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  39.6 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  39.6 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  39.61 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  44.08 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  39.86 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  42.57 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.43 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  44.85 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  37.41 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  38.85 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  43.24 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  39.6 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  43.24 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30720  ybaK/ebsC protein  43.79 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004197  transcriptional regulator  39.35 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  41.45 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  41.01 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  38.93 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  43.24 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.22 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  41.55 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  37.91 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  42.68 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  42.68 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  40.14 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  38.93 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  46.97 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  42.68 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  38.93 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  38.93 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  42.68 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  42.68 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  38.93 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  42.68 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  42.68 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  38.93 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>