More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2127 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
261 aa  503  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  70.11 
 
 
261 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  67.82 
 
 
261 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  62.84 
 
 
261 aa  335  5.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  62.84 
 
 
272 aa  333  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  62.7 
 
 
272 aa  323  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  54 
 
 
252 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  57.52 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  49.42 
 
 
270 aa  249  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  51.72 
 
 
263 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  53.11 
 
 
263 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  51.29 
 
 
263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  49.03 
 
 
259 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  49.79 
 
 
249 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  44.36 
 
 
266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  45.74 
 
 
268 aa  221  9e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  45.74 
 
 
268 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  45.74 
 
 
268 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  48.56 
 
 
256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  47.41 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  48.56 
 
 
269 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  48.56 
 
 
269 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4374  hypothetical protein  51.41 
 
 
264 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  48.15 
 
 
256 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  48.33 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  47.74 
 
 
256 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  47.74 
 
 
256 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  47.74 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  44.02 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  42.64 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  50.62 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  45.56 
 
 
268 aa  211  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  43.97 
 
 
259 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  43.19 
 
 
259 aa  203  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  44.35 
 
 
267 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  44.4 
 
 
269 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  44.4 
 
 
269 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  44.4 
 
 
269 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  44.4 
 
 
269 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  44.4 
 
 
269 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  44.4 
 
 
269 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  44.4 
 
 
269 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  44.4 
 
 
269 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  44.4 
 
 
269 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  45.38 
 
 
253 aa  202  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  41.47 
 
 
266 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  43.02 
 
 
266 aa  198  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  43.02 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  43.09 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  44.26 
 
 
260 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  43.1 
 
 
256 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  41.2 
 
 
257 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  44.59 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  43.27 
 
 
254 aa  188  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  41.25 
 
 
251 aa  185  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  40.83 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  39.68 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  42.37 
 
 
253 aa  180  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  42.06 
 
 
257 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  40.25 
 
 
253 aa  175  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  38.75 
 
 
257 aa  175  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  39.46 
 
 
223 aa  174  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  38.57 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  42.98 
 
 
247 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  44.21 
 
 
254 aa  171  9e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  38.46 
 
 
251 aa  171  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  40.93 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  41.46 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  41.46 
 
 
254 aa  165  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  36.4 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  40.25 
 
 
256 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  41.13 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  42.08 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  36 
 
 
255 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  40.25 
 
 
286 aa  158  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  39.68 
 
 
252 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  36.69 
 
 
250 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  35.63 
 
 
255 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  40.71 
 
 
254 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  40.65 
 
 
259 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5469  hypothetical protein  40.32 
 
 
264 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51215  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  38.87 
 
 
263 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  34.66 
 
 
256 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  39.27 
 
 
262 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  39.3 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  35.22 
 
 
255 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  37.4 
 
 
261 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  34.66 
 
 
256 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  37.5 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  33.85 
 
 
256 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  35.22 
 
 
255 aa  151  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  34.66 
 
 
256 aa  151  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  34.68 
 
 
256 aa  151  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  41.85 
 
 
264 aa  151  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  38.11 
 
 
252 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>