141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2763 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  314  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  69.8 
 
 		 164 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  68.92 
 
 		 187 aa  216  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  67.11 
 
 		 174 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  69.06 
 
 		 180 aa  203  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  67.88 
 
 		 168 aa  202  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  70.54 
 
 		 164 aa  201  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  67.15 
 
 		 171 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  68.94 
 
 		 152 aa  197  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  53.74 
 
 		 155 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  53.42 
 
 		 177 aa  163  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  52.59 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  52.59 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  55.15 
 
 		 201 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  54.81 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  50.78 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  55.46 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  50.42 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  55.46 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  55.46 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  49.65 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0757  hypothetical protein  55.46 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.065716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  48.98 
 
 		 166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  48.28 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  49.31 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  48.28 
 
 		 169 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  48.28 
 
 		 169 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  48.28 
 
 		 169 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  47.59 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0562  hypothetical protein  48.37 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0354219  hitchhiker  0.000345519 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  47.59 
 
 		 169 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0794  hypothetical protein  48.23 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  48.25 
 
 		 172 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  49.15 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1466  protein of unknown function DUF192  48.76 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.002216  normal  0.978305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  43.66 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  47.86 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  46.9 
 
 		 145 aa  114  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  43.59 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  39.39 
 
 		 223 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  44.04 
 
 		 217 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  39.1 
 
 		 154 aa  103  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  38.3 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  36.62 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  37.29 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  36.03 
 
 		 161 aa  97.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  39.86 
 
 		 184 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  36.42 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  43.36 
 
 		 176 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  45.71 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  43.36 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  35.06 
 
 		 159 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  36.51 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  36.72 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  39.34 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  39.34 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  39.82 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  40.52 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  40.82 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0382  hypothetical protein  41.38 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.562846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  42 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  39.22 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  36.05 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  38.98 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  43.52 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  36.63 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0065  hypothetical protein  40.2 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  32.17 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  39 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  38.83 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  32.85 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  38 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  32 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  34.91 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  32.41 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2374  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  36.94 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1454  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  37 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  32 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  29.05 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  34.82 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  36.54 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  38.83 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  38.83 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  33.93 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  37.74 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  38.02 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  32.45 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  33.06 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  39.62 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1009  protein of unknown function DUF192  32.87 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  39.08 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  34.45 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  38.46 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>