120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2693 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2693  HD-GYP domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1852  putative metal dependent phosphohydrolase  53.97 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3466  putative metal dependent phosphohydrolase  53.53 
 
 		 330 aa  332  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2752  putative metal dependent phosphohydrolase  52.88 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2242  putative metal dependent phosphohydrolase  52.88 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4783  putative metal dependent phosphohydrolase  51.74 
 
 		 329 aa  302  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0983875  normal  0.561862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1003  putative metal dependent phosphohydrolase  38.34 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4666  putative metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 403 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2795  hypothetical protein  39.82 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4051  HD-GYP domain-containing protein  36.4 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0489  HD-GYP domain-containing protein  31.63 
 
 		 402 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2773  hypothetical protein  29.79 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4311  putative metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1357  metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 		 399 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2647  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.427362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0373  putative metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 410 aa  93.2  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  30.27 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  30.91 
 
 		 375 aa  82.4  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 		 448 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 448 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  24.47 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  27.51 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  21.16 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  22.16 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  24.73 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  23.88 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  24.6 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  25.95 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1256  HD domain-containing protein  25.12 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0488462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  22.58 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  22.75 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 431 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  23.12 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  23.11 
 
 		 399 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  23.39 
 
 		 390 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  24.29 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  24.55 
 
 		 412 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  24.32 
 
 		 393 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 		 448 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  23.74 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  24.2 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  21.86 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  20.67 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  22.33 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  24.29 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 		 413 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  27.46 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 534 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  22.46 
 
 		 407 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 		 419 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  25.98 
 
 		 488 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 		 375 aa  49.7  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  24.53 
 
 		 350 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0571  metal dependent phosphohydrolase  22.96 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 402 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  22.87 
 
 		 404 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  22.53 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  22.44 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  22.89 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  21.2 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  25.32 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2172  hypothetical protein  29.57 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.019429  normal  0.358158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  22.17 
 
 		 401 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3932  metal dependent phosphohydrolase  21.4 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  20.57 
 
 		 369 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  19.82 
 
 		 401 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  22.5 
 
 		 404 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0563  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  24.55 
 
 		 446 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  22.5 
 
 		 406 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  21.43 
 
 		 392 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  21.93 
 
 		 435 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  21.08 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  23.33 
 
 		 435 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  23.89 
 
 		 431 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  25.44 
 
 		 435 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4403  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0688  metal dependent phosphohydrolase  22.83 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.96208  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  22.11 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  24.63 
 
 		 561 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  22.95 
 
 		 401 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  19.52 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  20.43 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>