More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1507 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 201 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  69.59 
 
 		 200 aa  281  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  63.82 
 
 		 204 aa  277  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  68.39 
 
 		 204 aa  274  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  55.21 
 
 		 208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  56.41 
 
 		 207 aa  220  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  52.82 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  52.82 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  52.82 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  53.72 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 		 196 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  53.48 
 
 		 196 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  53.48 
 
 		 196 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  53.48 
 
 		 196 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  52.97 
 
 		 211 aa  211  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  53.48 
 
 		 196 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  53.48 
 
 		 196 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  53.48 
 
 		 196 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 		 196 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  53.48 
 
 		 196 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  52.82 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.94 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 194 aa  205  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  51.01 
 
 		 204 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  50.51 
 
 		 205 aa  204  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  52.43 
 
 		 203 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  50.77 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 196 aa  200  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  53.51 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 194 aa  187  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  47.31 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  49.44 
 
 		 180 aa  177  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  49.41 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  44.58 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 180 aa  124  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  33.14 
 
 		 176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 177 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 183 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  35.39 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  33.52 
 
 		 176 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  30.9 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  33.52 
 
 		 176 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 281 aa  105  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  34.76 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 		 184 aa  101  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  31.46 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  31.46 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.46 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  31.46 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  31.46 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  31.46 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  31.46 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  30.9 
 
 		 179 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 187 aa  97.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  30.9 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  32.28 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  34.76 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  29.78 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 184 aa  94.7  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  38.89 
 
 		 183 aa  94.7  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 189 aa  94.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 173 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 173 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 169 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  35.81 
 
 		 171 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 189 aa  91.3  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  32.76 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  31.95 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 172 aa  89.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>