208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5125 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3891  putative endoribonuclease L-PSP  81.63 
 
 		 152 aa  248  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  71.71 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  71.71 
 
 		 154 aa  221  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  70.47 
 
 		 157 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  41.06 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  43.14 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  35.33 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  42.96 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  41.84 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  41.96 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  42.25 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  42.97 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  40.56 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  42.66 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  42.18 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  41.55 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  39.44 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  42.55 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 155 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  40.85 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  44.27 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  41.55 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  40.14 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  44.27 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  40.85 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2711  YjgF family translation initiation inhibitor  42.95 
 
 		 172 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  36.18 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  38.16 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  42.65 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  39.44 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1960  hypothetical protein  36.49 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  39.07 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  41.01 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  39.33 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  39.57 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  40.77 
 
 		 407 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  38.51 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 164 aa  104  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  38.16 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  36.18 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  34.67 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  36.5 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1542  hypothetical protein  63.86 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.199996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  35.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  35.33 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  35.33 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  35.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  35.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  35.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  35.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  40.31 
 
 		 409 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  34.44 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  33.77 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  38.19 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  34.67 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  38.19 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  36.18 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  36.18 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  41.01 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  38.19 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  35.57 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  36.18 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  39.85 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  34.67 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2204  Endoribonuclease L-PSP  48.95 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  35.1 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>