50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4283 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  481  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  71.49 
 
 		 253 aa  348  7e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  68 
 
 		 251 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  69.11 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  65.04 
 
 		 249 aa  298  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  68.24 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  61.29 
 
 		 270 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  61.7 
 
 		 249 aa  279  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  63.27 
 
 		 249 aa  277  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  61.7 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  66.44 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  43.97 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  37.7 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  64.35 
 
 		 146 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  34.62 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  34.62 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  34.66 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  32.11 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  28.7 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  31.56 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  27.63 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  25.31 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  27.92 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  22.13 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  26.86 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  25.55 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  28.15 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  26.86 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  21.14 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  27.52 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  29.95 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  21.3 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2549  protein of unknown function DUF81  24.7 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.491339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  20.87 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  25.55 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  25.55 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  25.55 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  21.63 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  27.88 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  27.72 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  24.12 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  24.1 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  27.73 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  31.61 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  29.09 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  19.77 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  27.42 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  28.18 
 
 		 250 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  28.64 
 
 		 250 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>