26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3473 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 281 aa  594  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  29.74 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  27.56 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 416 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  29.12 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  27.97 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  33.75 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  29.93 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  27.82 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  29.34 
 
 		 349 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  23.35 
 
 		 401 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  27.43 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  26.51 
 
 		 614 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  23.83 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  27.45 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  27.83 
 
 		 600 aa  66.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  21.16 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  27.44 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  27.27 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  23.61 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  22.51 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  22.88 
 
 		 465 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.72 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  25.31 
 
 		 461 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  25.38 
 
 		 787 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49130  predicted protein  26.52 
 
 		 472 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>