More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3390 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  100 
 
 
542 aa  1081    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  81.25 
 
 
560 aa  848    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3229  histidine kinase  56.42 
 
 
557 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.6 
 
 
557 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0007  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 
500 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3925  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 
501 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.306809  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 
499 aa  359  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  45.77 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 
494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 
494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  46.72 
 
 
494 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  46.72 
 
 
494 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 
494 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  46.11 
 
 
488 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  46.11 
 
 
488 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  46.11 
 
 
488 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3340  sensor histidine kinase  45.14 
 
 
495 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  46.11 
 
 
488 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 
494 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.37 
 
 
494 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  46.01 
 
 
495 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
493 aa  343  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  35.47 
 
 
517 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
487 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
524 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  33.05 
 
 
526 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.71 
 
 
509 aa  233  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.36 
 
 
513 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
531 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
481 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  33.26 
 
 
501 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
515 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
517 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  33.86 
 
 
523 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
515 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  33.66 
 
 
817 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  34.04 
 
 
463 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  33.6 
 
 
505 aa  223  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  33.6 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  33.6 
 
 
505 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
519 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  33.6 
 
 
505 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
515 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  33.66 
 
 
518 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  32.46 
 
 
499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.28 
 
 
515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  35.95 
 
 
506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  33.61 
 
 
517 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
484 aa  217  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  32.94 
 
 
517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
485 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
482 aa  213  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  32.37 
 
 
481 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
493 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  33.07 
 
 
481 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
471 aa  203  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  32.45 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  34.36 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  31.61 
 
 
462 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
478 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  31.38 
 
 
518 aa  193  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  34.21 
 
 
466 aa  193  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  32.43 
 
 
480 aa  193  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  33.05 
 
 
467 aa  190  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.96 
 
 
475 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  32.29 
 
 
467 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  40.18 
 
 
438 aa  189  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  38.36 
 
 
441 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  34.31 
 
 
439 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  32.68 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
459 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
465 aa  183  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
455 aa  183  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
459 aa  183  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.409159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
448 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  31.53 
 
 
496 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  29.55 
 
 
500 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  33.18 
 
 
460 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
457 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
463 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  39.26 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  39.26 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  32.27 
 
 
504 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  39.26 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  39.26 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  39.26 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
445 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  39.26 
 
 
438 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  39.26 
 
 
438 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
472 aa  180  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  32.46 
 
 
460 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
445 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  32.24 
 
 
460 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0710689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>